雖然三代試管篩查可以排除大部分遺傳疾病風險，但并不能完全保證優生。這是因為一些遺傳疾病可能在后續發育過程中才會顯現出來，而且還有一些無法通過目前的技術手段進行檢測的遺傳變異在試管嬰兒技術中，受精卵在培養、移植等環節也存在一定的風險。盡管經過篩查選取的胚胎具有較高的健康概率，但并不能保證100%的成功率。在選擇三代試管篩查后的胚胎時，夫婦應該充分了解其風險和局限性，并在醫生的指導下做出明智決策。
三代試管篩查后的胚胎能否保證優生
雖然三代試管篩查在很多方面能夠顯著提高胚胎的質量，并有效減少一些遺傳疾病的風險，但它并不能完全“保證”優生。雖然PGS(胚胎染色體篩查)和PGD(胚胎基因篩查)可以有效篩選出大多數的染色體異常或單基因疾病的胚胎。但它們并不能發現所有可能的遺傳或健康問題。有些基因突變或健康問題可能不在篩查范圍內，或者可能會因為技術的局限性出現假陰性或假陽性結果。
另外，篩查雖然能夠剔除一些不健康的胚胎，但胚胎的質量不僅僅取決于基因或染色體是否正常，還與其他因素有關，比如卵母細胞的質量、精子質量、受精過程、培養條件等。因此，篩查后選出來的胚胎也可能因為其他生理因素(如胚胎發育不良、子宮內環境不佳等)導致懷孕失敗或流產。
女性年齡對胚胎的質量有重要影響，隨著年齡的增長，卵巢功能衰退，卵子的質量也會下降，即使通過三代試管篩查選取了看似健康的胚胎，懷孕的成功率仍然會受到年齡的影響。對于高齡女性來說，即便篩查后的胚胎沒有明顯的染色體異常，成功妊娠的幾率仍然較低。
第三代試管生的孩子健康嗎
第三代試管嬰兒生的孩子健康是有保障的，到目前為止，經PGD/PGS檢測最多可以篩查診斷出100多種遺傳疾病，對于一些常見的遺傳性疾病，可以進行產前的篩查診斷的。如果雙方有任何一方有遺傳性疾病可以進行第3代的試管技術。另一方面，PGD/PGS的準確性也備受關注，因為胚胎在種植前存在嵌合的可能，只分析來源于胚胎滋養外胚層的3-10個細胞，顯然不能夠完全代表整個胚胎的情況，其診斷率、準確性有一點局限性。
且懷孕妊娠是漫長的過程，孕期中可能會受到其他一些因素的影響，導致胚胎發育的異常。三代試管只是一個提高成功率，擇優而用的手段，所以建議大家做三代試管嬰兒成功懷孕了，還是得及時進行產前診斷，這是非常重要且有必要的。