有數據表明，第3天的“優質胚胎”，有60%左右發育為囊胚，40%左右不能發育為囊胚，所以囊胚培養過程中會出現優質胚胎也沒有形成囊胚的情況。精子或卵子質量、胚胎質量、胚胎發育問題、實驗室的環境、胚胎染色體異常等等都是影響囊胚形成的關鍵因素，任何一個環節出了問題都可能導致養囊失敗。
　　試管嬰兒為什么優胚養囊也會失敗
　　胚胎的評分，只是胚胎學家根據相關指標對胚胎進行的“外貌”綜合評估，不是所有的卵裂期胚胎都能形成囊胚，只有生長發育潛能好的胚胎才可以培養成囊胚。所以，優胚不一定能養成優囊，甚至不一定能養成囊胚。通常，養囊失敗的原因有以下這些。
　　1、精子或卵子質量
　　養囊不是說養就可以養，至少得符合卵泡個數夠，胚胎質量優質的條件，否則不建議養囊。
　　由于養囊對胚胎的質量要求較為嚴格，而胚胎的原料是精子和卵子，如果精子和卵子一方或雙方的質量不好，將直接影響胚胎的質量，這樣的胚胎容易停止生長，還沒變身為囊胚，就已經全軍覆沒。因此，精子或卵子或者胚胎質量不佳的患者，建議盡早移植胚胎，只有子宮才是它們的最佳生存場所。
　　2、實驗室的環境
　　除了胚胎自身的質量，養囊還要求實驗室的氧氣、溫度保持平衡，幅度稍微有點變化都會改變最終的結局。由于囊胚等級高，發育快，所以著床率基本高于正常胚胎，尤其是對身體情況不便多胎妊娠的患者而言，囊胚的妊娠率更高，而且多胎危險性更低。
　　3、胚胎發育問題
　　在囊胚培養過程中，不是所有的卵裂期胚胎都能形成囊胚，只有生長發育潛能好的胚胎才可以培養成囊胚。由于傳統形態學評估是根據一定的形態學標準和發育速度(靠“顏值”和“個頭”)來選擇胚胎，不能準確地預測胚胎的發育潛能，即使是胚胎培養第3天評分為8-9細胞的優質胚胎也有可能不會形成囊胚。
　　4、胚胎染色體異常
　　胚胎染色體異常也是囊胚培養失敗的一個主要原因。一般來說，夫妻任一方越高齡，胚胎染色體異常的風險越高。有研究表明，染色體異常胚胎的囊胚形成率約為正常胚胎的50%，并且染色體異常程度越嚴重，囊胚形成率越低。如，胚胎發育速度慢、胚胎多碎片、胚胎多空泡、卵裂球分裂模式異常等。提示胚胎發育潛能偏低。
　　囊胚培養是一個優勝劣汰的選擇過程，囊胚培養淘汰了劣質，部分染色體異常的胚胎;獲得發育潛能好，部分染色體正常的胚胎。即使是有質胚胎還是有養囊失敗的可能。